Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6L9

ERMARD, Endoplasmic reticulum membrane-associated RNA degradation protein, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERMARDQ5T6L9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERMARDQ5T6L9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERMARDQ5T6L9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERMARDQ5T6L9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERMARDQ5T6L9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERMARDQ5T6L9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERMARDQ5T6L9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms