Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms