Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LDLRAP1Q5SW96 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAP1Q5SW96 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms