Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms