Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAVIN4Q5BKX8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms