Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNI3KQ59H18 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3KQ59H18 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms