Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAN3Q58A45 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAN3Q58A45 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms