Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDRD12Q587J7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms