Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms