Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDNFQ49AH0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDNFQ49AH0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms