Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP41Q3LFD5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms