Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TWISTNBQ3B726 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TWISTNBQ3B726 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms