Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC57Q2TAC2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms