Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ISXQ2M1V0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ISXQ2M1V0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ISXQ2M1V0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ISXQ2M1V0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ISXQ2M1V0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ISXQ2M1V0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ISXQ2M1V0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ISXQ2M1V0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ISXQ2M1V0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ISXQ2M1V0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms