Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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