Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM187BQ17R55 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM187BQ17R55 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms