Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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NDUFA9Q16795 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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NDUFA9Q16795 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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NDUFA9Q16795 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDUFA9Q16795 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms