Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA3Q16787 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms