Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms