Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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