Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN1Q16512 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN1Q16512 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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