Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAMA4Q16363 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMA4Q16363 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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