Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALX1Q15699 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALX1Q15699 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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