Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKIV2LQ15477 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKIV2LQ15477 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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