Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIX1Q15475 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIX1Q15475 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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