Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF4Q15306 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRF4Q15306 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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