Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRRQ15256 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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PTPRRQ15256 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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PTPRRQ15256 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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PTPRRQ15256 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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PTPRRQ15256 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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PTPRRQ15256 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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PTPRRQ15256 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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PTPRRQ15256 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRRQ15256 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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