Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms