Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSHL1Q14406 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSHL1Q14406 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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