Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE1CQ14123 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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