Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms