Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
NEUROD1Q13562 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms