Protein–RNA interactions for Protein: Q13530

SERINC3, Serine incorporator 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC3Q13530 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SERINC3Q13530 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERINC3Q13530 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms