Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCIRG1Q13488 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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