Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3BPQ13352 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms