Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SKP2Q13309 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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