Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3BQ13214 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SEMA3BQ13214 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SEMA3BQ13214 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SEMA3BQ13214 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SEMA3BQ13214 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SEMA3BQ13214 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SEMA3BQ13214 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3BQ13214 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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