Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF2Q12933 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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TRAF2Q12933 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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TRAF2Q12933 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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TRAF2Q12933 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF2Q12933 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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TRAF2Q12933 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TRAF2Q12933 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TRAF2Q12933 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TRAF2Q12933 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TRAF2Q12933 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TRAF2Q12933 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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