Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFEMP1Q12805 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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EFEMP1Q12805 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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EFEMP1Q12805 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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EFEMP1Q12805 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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EFEMP1Q12805 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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EFEMP1Q12805 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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EFEMP1Q12805 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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EFEMP1Q12805 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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