Protein–RNA interactions for Protein: Q12468

RRI1, COP9 signalosome complex subunit 5, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI1Q12468 ARP8YOR141C 2646 nt2.27□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 KTI11YBL071W-A 249 nt2.26□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 RGA2YDR379W 3030 nt2.26□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 VPS35YJL154C 2835 nt2.26□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 YGL149WYGL149W 306 nt2.25□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 YOP1YPR028W 543 nt2.25□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 YPR099CYPR099C 357 nt2.25□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 YEF3YLR249W 3135 nt2.25□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 SWA2YDR320C 2007 nt2.25□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 BFA1YJR053W 1725 nt2.25□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 SGD1YLR336C 2700 nt2.25□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 PDR1YGL013C 3207 nt2.25□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 PDR11YIL013C 4236 nt2.24□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 YGR050CYGR050C 357 nt2.24□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 SMD1YGR074W 441 nt2.24□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 PHS1YJL097W 654 nt2.24□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 CRS5YOR031W 210 nt2.24□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 snR51snR51 107 nt2.24□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 DOT6YER088C 2013 nt2.24□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 OSH6YKR003W 1347 nt2.23□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 PHO2YDL106C 1680 nt2.23□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.23□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.23□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.23□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.23□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.23□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.23□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 YJL015CYJL015C 285 nt2.23□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 PDR3YBL005W 2931 nt2.23□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 HTL1YCR020W-B 237 nt2.22□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 snR70snR70 164 nt2.22□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 SPG3YDR504C 384 nt2.22□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 YGL069CYGL069C 465 nt2.22□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 NOP10YHR072W-A 177 nt2.22□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 RPS27AYKL156W 249 nt2.22□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 HTB2YBL002W 396 nt2.22□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 SNC2YOR327C 348 nt2.22□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 SVL3YPL032C 2478 nt2.22□□□□□ -2.05
RRI1Q12468 RBK1YCR036W 1002 nt2.21□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 FMP16YDR070C 282 nt2.21□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.21□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.21□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YNL018CYNL018C 1839 nt2.21□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 INP51YIL002C 2841 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YFH1YDL120W 525 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YRB1YDR002W 606 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YDR048CYDR048C 315 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 CYC7YEL039C 342 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 ACB1YGR037C 264 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YHL041WYHL041W 450 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 SEC16YPL085W 6588 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 PAN3YKL025C 2040 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 VPS16YPL045W 2397 nt2.2□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.19□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 SAR1YPL218W 573 nt2.19□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YBR277CYBR277C 402 nt2.19□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 MRP10YDL045W-A 288 nt2.18□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YGR069WYGR069W 336 nt2.18□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 SNU114YKL173W 3027 nt2.18□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 CSF1YLR087C 8877 nt2.18□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 VPS13YLL040C 9435 nt2.18□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 HOS4YIL112W 3252 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 TOF2YKR010C 2316 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 TAE2YPL009C 3117 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YPR097WYPR097W 3222 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YDR344CYDR344C 444 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YIL059CYIL059C 366 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 JLP2YMR132C 627 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YOR055WYOR055W 435 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 NUP170YBL079W 4509 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 DBP6YNR038W 1890 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 TMN3YER113C 2121 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 LYS9YNR050C 1341 nt2.17□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 NEW1YPL226W 3591 nt2.16□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 SOK2YMR016C 2358 nt2.16□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 DFG16YOR030W 1860 nt2.16□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 GUP1YGL084C 1683 nt2.16□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 ALG13YGL047W 609 nt2.16□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 EMC6YLL014W 327 nt2.16□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 DAD3YBR233W-A 285 nt2.16□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 UBP15YMR304W 3693 nt2.16□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 TOF1YNL273W 3717 nt2.16□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 EDS1YBR033W 2760 nt2.15□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 HSC82YMR186W 2118 nt2.15□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 SCD5YOR329C 2619 nt2.15□□□□□ -2.06
RRI1Q12468 YDL062WYDL062W 426 nt2.15□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 snR80snR80 171 nt2.15□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 PRE4YFR050C 801 nt2.15□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 YIL102CYIL102C 306 nt2.15□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 RPA34YJL148W 702 nt2.15□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.15□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 ALK2YBL009W 2031 nt2.15□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 NUP100YKL068W 2880 nt2.15□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 INP53YOR109W 3324 nt2.14□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 YOL098CYOL098C 3114 nt2.14□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 SPO22YIL073C 2928 nt2.14□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.14□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 YGR265WYGR265W 411 nt2.14□□□□□ -2.07
RRI1Q12468 YBR224WYBR224W 516 nt2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.2 ms