Protein–RNA interactions for Protein: Q12416

WHI5, G1-specific transcriptional repressor WHI5, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WHI5Q12416 JSN1YJR091C 3276 nt3.03□□□□□ -1.92
WHI5Q12416 NOP53YPL146C 1368 nt3.03□□□□□ -1.92
WHI5Q12416 TRS130YMR218C 3309 nt3.03□□□□□ -1.92
WHI5Q12416 RAX2YLR084C 3663 nt3.03□□□□□ -1.92
WHI5Q12416 SWA2YDR320C 2007 nt3.03□□□□□ -1.92
WHI5Q12416 SLA1YBL007C 3735 nt3.03□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 SPO22YIL073C 2928 nt3.03□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 INP2YMR163C 2118 nt3.02□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 RPH1YER169W 2391 nt3.02□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 MGM1YOR211C 2646 nt3.02□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 GPG1YGL121C 381 nt3.02□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 RPL42BYHR141C 321 nt3.02□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 RPL42AYNL162W 321 nt3.02□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 YBL083CYBL083C 426 nt3.02□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 SET2YJL168C 2202 nt3.01□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 PXA2YKL188C 2562 nt3.01□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 SMC6YLR383W 3345 nt3.01□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 ERP6YGL002W 651 nt3.01□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 CSE2YNR010W 450 nt3.01□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.01□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 YCL023CYCL023C 348 nt3.01□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 IRR1YIL026C 3453 nt3.01□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 ILS1YBL076C 3219 nt3.01□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 ISD11YER048W-A 285 nt3□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 UBP14YBR058C 2346 nt2.99□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 STB4YMR019W 2850 nt2.99□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.99□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 YLR294CYLR294C 330 nt2.99□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 NUP100YKL068W 2880 nt2.98□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 SSQ1YLR369W 1974 nt2.98□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 SWI5YDR146C 2130 nt2.98□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.98□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 RPS29AYLR388W 171 nt2.98□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 RPS8AYBL072C 603 nt2.98□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 SAP1YER047C 2694 nt2.98□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 AUS1YOR011W 4185 nt2.97□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 EMP24YGL200C 612 nt2.97□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 IES4YOR189W 351 nt2.97□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 PLC1YPL268W 2610 nt2.97□□□□□ -1.93
WHI5Q12416 VIK1YPL253C 1944 nt2.96□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 RFX1YLR176C 2436 nt2.96□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YDR286CYDR286C 345 nt2.96□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.96□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 RPB10YOR210W 213 nt2.96□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YPR203WYPR203W 309 nt2.96□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 EDS1YBR033W 2760 nt2.96□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 MDM1YML104C 3384 nt2.95□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.95□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 SSS1YDR086C 243 nt2.95□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 PAU2YEL049W 363 nt2.95□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YGL052WYGL052W 306 nt2.95□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 PAM16YJL104W 450 nt2.95□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 GEA1YJR031C 4227 nt2.95□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 TFC8YPL007C 1767 nt2.95□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 POL3YDL102W 3294 nt2.94□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 SPT21YMR179W 2277 nt2.94□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 PTP3YER075C 2787 nt2.94□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 FAR11YNL127W 2862 nt2.94□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YCR043CYCR043C 384 nt2.94□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YNL198CYNL198C 303 nt2.94□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 SWR1YDR334W 4545 nt2.94□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YDR209CYDR209C 414 nt2.93□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 HYP2YEL034W 474 nt2.93□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YJL182CYJL182C 318 nt2.93□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 LCL1YPL056C 306 nt2.93□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 RPO41YFL036W 4056 nt2.93□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 SGM1YJR134C 2124 nt2.93□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YKU80YMR106C 1890 nt2.92□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 TOP2YNL088W 4287 nt2.92□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 SRB8YCR081W 4284 nt2.92□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 ATG13YPR185W 2217 nt2.91□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 PNC1YGL037C 651 nt2.91□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 VPS55YJR044C 423 nt2.91□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.91□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 COX14YML129C 213 nt2.91□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 CHS2YBR038W 2892 nt2.91□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 VMR1YHL035C 4779 nt2.91□□□□□ -1.94
WHI5Q12416 BUD4YJR092W 4344 nt2.9□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.9□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.9□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 DCP2YNL118C 2913 nt2.9□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 MET18YIL128W 3099 nt2.89□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 MNE1YOR350C 1992 nt2.89□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 PSF1YDR013W 627 nt2.89□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 RPL23BYER117W 414 nt2.89□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 FMP32YFL046W 624 nt2.89□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 PFD1YJL179W 330 nt2.89□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.89□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 PDE2YOR360C 1581 nt2.89□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 GCN1YGL195W 8019 nt2.89□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 YIL169CYIL169C 2988 nt2.88□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 VPS8YAL002W 3825 nt2.88□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.88□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 NMD2YHR077C 3270 nt2.88□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 PFF1YBR074W 2931 nt2.88□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 LYS14YDR034C 2373 nt2.87□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 SRO77YBL106C 3033 nt2.87□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.87□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 RRT15YLR162W-A 189 nt2.87□□□□□ -1.95
WHI5Q12416 GOT1YMR292W 417 nt2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 81.1 ms