Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 RPS17BYDR447C 411 nt4.36□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 YDR521WYDR521W 336 nt4.36□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 YFL065CYFL065C 309 nt4.36□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 YGR051CYGR051C 324 nt4.36□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 MBB1YJL199C 327 nt4.36□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 YPR203WYPR203W 309 nt4.36□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 ERB1YMR049C 2424 nt4.36□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 PDR8YLR266C 2106 nt4.36□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 ATG13YPR185W 2217 nt4.36□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 COG3YER157W 2406 nt4.35□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt4.35□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 DYN2YDR424C 279 nt4.34□□□□□ -1.71
MSB4Q12317 GIN4YDR507C 3429 nt4.34□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt4.33□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt4.33□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt4.33□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt4.33□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt4.33□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt4.33□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt4.33□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 NPR1YNL183C 2373 nt4.32□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 SPT23YKL020C 3249 nt4.32□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 PBY1YBR094W 2262 nt4.32□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 NUP85YJR042W 2235 nt4.32□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt4.32□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt4.32□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 TRK1YJL129C 3708 nt4.32□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 NAT1YDL040C 2565 nt4.32□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 URB2YJR041C 3525 nt4.32□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 SEG1YMR086W 2883 nt4.32□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 KAP104YBR017C 2757 nt4.31□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 MSD1YPL104W 1977 nt4.31□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 IOC2YLR095C 2439 nt4.31□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 SIP3YNL257C 3690 nt4.31□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 RSC1YGR056W 2787 nt4.31□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 APL4YPR029C 2499 nt4.3□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 SWI1YPL016W 3945 nt4.3□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 IMH1YLR309C 2736 nt4.3□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 REC8YPR007C 2043 nt4.29□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 SLM2YNL047C 1971 nt4.29□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 SRP14YDL092W 441 nt4.29□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt4.29□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 RPL42BYHR141C 321 nt4.28□□□□□ -1.72
MSB4Q12317 CHS6YJL099W 2241 nt4.27□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 YGL140CYGL140C 3660 nt4.27□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 RPL20AYMR242C 519 nt4.27□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 VAS1YGR094W 3315 nt4.27□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 SEC15YGL233W 2733 nt4.27□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 YPR089WYPR089W 2667 nt4.27□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 AIM44YPL158C 2277 nt4.26□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 VPH1YOR270C 2523 nt4.26□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt4.26□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 RPS8AYBL072C 603 nt4.26□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 DUF1YOL087C 3351 nt4.25□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 snR75snR75 89 nt4.25□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 SMT3YDR510W 306 nt4.25□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 snR43snR43 209 nt4.25□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 GIS1YDR096W 2685 nt4.25□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 NUP120YKL057C 3114 nt4.24□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 EMC1YCL045C 2283 nt4.24□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 PAU3YCR104W 375 nt4.24□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 BCH1YMR237W 2175 nt4.24□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 SGD1YLR336C 2700 nt4.23□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 GIS4YML006C 2325 nt4.23□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 YKL050CYKL050C 2769 nt4.23□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt4.23□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 RTC6YPL183W-A 282 nt4.23□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt4.23□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 NIP100YPL174C 2607 nt4.23□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 CHD1YER164W 4407 nt4.22□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 VMA9YCL005W-A 222 nt4.22□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 YJL070CYJL070C 2667 nt4.22□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 KRE5YOR336W 4098 nt4.22□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 SPC98YNL126W 2541 nt4.22□□□□□ -1.73
MSB4Q12317 CAT2YML042W 2013 nt4.21□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 PKH1YDR490C 2301 nt4.21□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 PFF1YBR074W 2931 nt4.21□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 ARO1YDR127W 4767 nt4.21□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 VPS34YLR240W 2628 nt4.21□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 YJL120WYJL120W 324 nt4.2□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 RSN1YMR266W 2862 nt4.2□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 SPT6YGR116W 4356 nt4.2□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 STE23YLR389C 3084 nt4.19□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 RPS25BYLR333C 327 nt4.19□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 LCL1YPL056C 306 nt4.19□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 PSO2YMR137C 1986 nt4.19□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 PXA2YKL188C 2562 nt4.18□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.18□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 YPP1YGR198W 2454 nt4.18□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 YLR149CYLR149C 2193 nt4.17□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 MSC6YOR354C 2079 nt4.17□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 SMY2YBR172C 2223 nt4.17□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 RLI1YDR091C 1827 nt4.17□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt4.17□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 YCR043CYCR043C 384 nt4.17□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 FMP16YDR070C 282 nt4.17□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 YBL012CYBL012C 402 nt4.17□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 YIL080WYIL080W 4722 nt4.16□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 RFX1YLR176C 2436 nt4.16□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 YDR089WYDR089W 2610 nt4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.7 ms