Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 RNR4YGR180C 1038 nt0.72□□□□□ -2.29
CCW12Q12127 RTT102YGR275W 474 nt0.72□□□□□ -2.29
CCW12Q12127 RPL37AYLR185W 267 nt0.72□□□□□ -2.29
CCW12Q12127 CGI121YML036W 546 nt0.72□□□□□ -2.29
CCW12Q12127 CTK3YML112W 891 nt0.72□□□□□ -2.29
CCW12Q12127 YOR364WYOR364W 369 nt0.72□□□□□ -2.29
CCW12Q12127 ATP20YPR020W 348 nt0.72□□□□□ -2.29
CCW12Q12127 DGR2YKL121W 2559 nt0.72□□□□□ -2.29
CCW12Q12127 SGD1YLR336C 2700 nt0.72□□□□□ -2.29
CCW12Q12127 AZF1YOR113W 2745 nt0.72□□□□□ -2.29
CCW12Q12127 MSN5YDR335W 3675 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 NUP188YML103C 4968 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 CRG1YHR209W 876 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YPR146CYPR146C 330 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YCL046WYCL046W 324 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 SMC1YFL008W 3678 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 EAF1YDR359C 2949 nt0.71□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 MAK10YEL053C 2202 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 OSH6YKR003W 1347 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 SEC5YDR166C 2916 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 RPL42BYHR141C 321 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 LCL2YLR104W 396 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YMR254CYMR254C 309 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 COX7YMR256C 183 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 RPL42AYNL162W 321 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YOR376WYOR376W 369 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YBR063CYBR063C 1215 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 POP7YBR167C 423 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 KAP122YGL016W 3246 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 DOP1YDR141C 5097 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 REF2YDR195W 1602 nt0.7□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 SMY1YKL079W 1971 nt0.69□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 VPS55YJR044C 423 nt0.69□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 SDS22YKL193C 1017 nt0.69□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.69□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YPR063CYPR063C 423 nt0.69□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 MDM32YOR147W 1869 nt0.69□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 RAD50YNL250W 3939 nt0.69□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 VPS52YDR484W 1926 nt0.68□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YDL211CYDL211C 1119 nt0.68□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YDR220CYDR220C 294 nt0.68□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.68□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YAL066WYAL066W 309 nt0.68□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 ERP4YOR016C 624 nt0.68□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 PAU24YBR301W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 SWT1YOR166C 1377 nt0.68□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 UFD2YDL190C 2886 nt0.67□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 snR79snR79 84 nt0.67□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YGL109WYGL109W 324 nt0.67□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 TAD1YGL243W 1203 nt0.67□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 LRP1YHR081W 555 nt0.67□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 CMS1YLR003C 876 nt0.67□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YPT6YLR262C 648 nt0.67□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 DDR48YMR173W 1293 nt0.67□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 HHT1YBR010W 411 nt0.67□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 MSS11YMR164C 2277 nt0.67□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YBR184WYBR184W 1572 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 SRP14YDL092W 441 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YGL217CYGL217C 342 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YGR228WYGR228W 345 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 RCN1YKL159C 636 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 TIM18YOR297C 579 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 FMP23YBR047W 528 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YPR096CYPR096C 303 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 YCL002CYCL002C 792 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 SLX4YLR135W 2247 nt0.66□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 SCC2YDR180W 4482 nt0.65□□□□□ -2.3
CCW12Q12127 CHZ1YER030W 462 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 PRE4YFR050C 801 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 YHR054CYHR054C 1065 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 ABM1YJR108W 372 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 YKL111CYKL111C 336 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 PAU18YLL064C 363 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 YLR198CYLR198C 360 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 PAU6YNR076W 363 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 snR14snR14 160 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 YPL197CYPL197C 414 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 BI4Q0120 1917 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 BUD3YCL014W 4911 nt0.65□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 MUK1YPL070W 1839 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 IES5YER092W 378 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 SNO3YFL060C 669 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 RPC10YHR143W-A 213 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 EMC5YIL027C 426 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 RPL40BYKR094C 387 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 YLL020CYLL020C 306 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 YLR271WYLR271W 825 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 YLR366WYLR366W 306 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 SNO2YNL334C 669 nt0.64□□□□□ -2.31
CCW12Q12127 SEF1YBL066C 3447 nt0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.6 ms