Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DHX9Q08211 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms