Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms