Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN3Q08043 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms