Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 TAF6YGL112C 1551 nt3.7□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 NIP100YPL174C 2607 nt3.7□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 BCK2YER167W 2556 nt3.69□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 PHO81YGR233C 3537 nt3.69□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 ERB1YMR049C 2424 nt3.69□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.69□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 FMP16YDR070C 282 nt3.69□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 TOP1YOL006C 2310 nt3.69□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 NUP133YKR082W 3474 nt3.68□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 TRK1YJL129C 3708 nt3.68□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 SPC98YNL126W 2541 nt3.68□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt3.68□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 IES6YEL044W 501 nt3.68□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.68□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 RDS1YCR106W 2499 nt3.68□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 SEF1YBL066C 3447 nt3.68□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 APL4YPR029C 2499 nt3.67□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 SPT23YKL020C 3249 nt3.67□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 SAK1YER129W 3429 nt3.67□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 FAP7YDL166C 594 nt3.67□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 RFX1YLR176C 2436 nt3.67□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 YFR016CYFR016C 3702 nt3.67□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 SLY1YDR189W 2001 nt3.66□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 CHD1YER164W 4407 nt3.66□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 YCR043CYCR043C 384 nt3.66□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 RPL42BYHR141C 321 nt3.66□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 COX19YLL018C-A 297 nt3.66□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 RPS25BYLR333C 327 nt3.66□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 APE2YKL157W 2859 nt3.66□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 ITC1YGL133W 3795 nt3.66□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 EDS1YBR033W 2760 nt3.66□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 MDV1YJL112W 2145 nt3.65□□□□□ -1.82
BUD20Q08004 VPS35YJL154C 2835 nt3.65□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 TRS120YDR407C 3870 nt3.64□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 FLO10YKR102W 3510 nt3.64□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 VBA4YDR119W 2307 nt3.64□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 YJL120WYJL120W 324 nt3.64□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 SLA1YBL007C 3735 nt3.64□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 RPN2YIL075C 2838 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 SNF5YBR289W 2718 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 HMG1YML075C 3165 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 SRP14YDL092W 441 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 ZIP2YGL249W 2115 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 YCL019WYCL019W 5313 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 KAP95YLR347C 2586 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 XRN1YGL173C 4587 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 ORC1YML065W 2745 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 TCB3YML072C 4638 nt3.63□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 PAU3YCR104W 375 nt3.62□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 AI2Q0055 2565 nt3.62□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 SMY1YKL079W 1971 nt3.62□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 SPT16YGL207W 3108 nt3.61□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 snR81snR81 201 nt3.6□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 RPS12YOR369C 432 nt3.6□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 CHS6YJL099W 2241 nt3.6□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 RPH1YER169W 2391 nt3.6□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 BOI1YBL085W 2943 nt3.6□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.59□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.59□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.59□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.59□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.59□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.59□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.59□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.59□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.59□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.59□□□□□ -1.83
BUD20Q08004 SPT6YGR116W 4356 nt3.59□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 VPS3YDR495C 3036 nt3.59□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 SNT1YCR033W 3681 nt3.58□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 PIP2YOR363C 2991 nt3.58□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 MYO5YMR109W 3660 nt3.58□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 OSH2YDL019C 3852 nt3.57□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 RPL23BYER117W 414 nt3.57□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 EMC1YCL045C 2283 nt3.57□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 UTP14YML093W 2700 nt3.57□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 SMY2YBR172C 2223 nt3.56□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 NPR3YHL023C 3441 nt3.56□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 OSH3YHR073W 2991 nt3.56□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 SBE22YHR103W 2559 nt3.56□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 DYN2YDR424C 279 nt3.56□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 RCY1YJL204C 2523 nt3.56□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 FRE2YKL220C 2136 nt3.56□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 COP1YDL145C 3606 nt3.56□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 CHO2YGR157W 2610 nt3.56□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 MNE1YOR350C 1992 nt3.55□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 TMA19YKL056C 504 nt3.55□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt3.55□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 RPO31YOR116C 4383 nt3.55□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 UBP11YKR098C 2154 nt3.53□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 TAF1YGR274C 3201 nt3.53□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 SET3YKR029C 2256 nt3.53□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt3.53□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 YNL114CYNL114C 372 nt3.53□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 YTA7YGR270W 4140 nt3.53□□□□□ -1.84
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