Protein–RNA interactions for Protein: Q07879

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, yeastyeast

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG10Q07879 RPS18BYML026C 441 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 BUD3YCL014W 4911 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 GPM2YDL021W 936 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 EMC5YIL027C 426 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 CGI121YML036W 546 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 YMR324CYMR324C 243 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 OSH6YKR003W 1347 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 IFH1YLR223C 3258 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 RTR2YDR066C 591 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 SRB7YDR308C 423 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 LSO2YGR169C-A 279 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 NUP145YGL092W 3954 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 PEP3YLR148W 2757 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 RAD50YNL250W 3939 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 RSM28YDR494W 1086 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 YGL217CYGL217C 342 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 ABM1YJR108W 372 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 TIM18YOR297C 579 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 snR14snR14 160 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 MUK1YPL070W 1839 nt0.78□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 SPC1YJR010C-A 285 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 HIT1YJR055W 495 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 RPL40BYKR094C 387 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 SEC22YLR268W 645 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 RPS7BYNL096C 573 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 SPR2YOR214C 711 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 TFB6YOR352W 1032 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YCK3YER123W 1575 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 SPR3YGR059W 1539 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 HTB1YDR224C 396 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 LAG1YHL003C 1236 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 BRX1YOL077C 876 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 SLX4YLR135W 2247 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 NUP82YJL061W 2142 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 DPB11YJL090C 2295 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 SGD1YLR336C 2700 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 DAD1YDR016C 285 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 LOC1YFR001W 615 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 CRG1YHR209W 876 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 TIM8YJR135W-A 264 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 RCN1YKL159C 636 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 URA10YMR271C 684 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 FMP23YBR047W 528 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 KAR3YPR141C 2190 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 snR59snR59 78 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 HYM1YKL189W 1200 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 DDR48YMR173W 1293 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YCL046WYCL046W 324 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 SEC1YDR164C 2175 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 SLS1YLR139C 1932 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 UBP3YER151C 2739 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YDL068WYDL068W 330 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 NHP2YDL208W 471 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 DFG10YIL049W 762 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 POL32YJR043C 1053 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 CDC39YCR093W 6327 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 YMR160WYMR160W 2451 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG10Q07879 NUP157YER105C 4176 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YDR521WYDR521W 336 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 RTR1YER139C 681 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 CUP1-1YHR053C 186 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 CUP1-2YHR055C 186 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YIR020CYIR020C 303 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 ARV1YLR242C 966 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 CMC4YMR194C-B 222 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 STB6YKL072W 2301 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YLL054CYLL054C 2532 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 REF2YDR195W 1602 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 SEC3YER008C 4011 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 IRC2YDR112W 309 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YGR265WYGR265W 411 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 RPL42BYHR141C 321 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 RPL42AYNL162W 321 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 IRC23YOR044W 474 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 SGO1YOR073W 1773 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 RPL16AYIL133C 600 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 RPL9BYNL067W 576 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YOL014WYOL014W 375 nt0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms