Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC3A1Q07837 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms