Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX8Q06710 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms